卷二十八：玉枢宝经赞附或问

卷二十九：灵宝毕法小乘

卷三十：灵宝毕法中乘

卷三十一：灵宝毕法大乘

卷三十二：修真传道集上

卷三十三：修真传道集下

卷三十四：文集上

卷三十五：文集中

卷三十六：文集下

卷三十七：葫头集上

卷三十八：葫头集下

卷三十九：涵三杂咏

卷四十：涵三语录

卷四十一：指玄篇

卷四十二：浑成篇

卷四十三：名坛新咏

卷四十四：语录会粹

卷四十五：福报指南

卷四十六：儒道同源

卷四十七：群言会粹

卷四十八：药石制

卷四十九：太乙金华宗旨

卷五十：金丹种子篇

卷五十一：警世功过格

卷五十二：十戒十行

卷五十三：度厄救劫救苦涤氛四神咒

卷五十四：雪过修真仙忏

卷五十五：敲爻歌沁园春百字碑注解

卷五十六：广化真经

卷五十七：治病仙方决疑签诗

卷五十八：金丹救劫度人宝忏

卷五十九：慈航无极宝忏

卷六十：证道成真心忏

卷六十一：禅宗正指上

卷六十二：禅宗正指中

卷六十三：禅宗正指下

卷六十四：吕祖诰