杨鹤接任总督后，王左挂等攻打宜川，被知县成材打退，转攻韩城，韩城官军没有将领，杨鹤任命参政洪承畴领兵抵御，俘获、斩杀了三百多人，韩城之围解除了，贼兵前往清涧。杨鹤接连上书朝廷请让各位大将返回驻地，没有结果，就起用了原先的将领杜文焕出来任职。延安知府张辇、都司艾穆在延川进逼贼兵，收降了贼首王子顺、张述圣、姬三儿，另外贼首王嘉胤洗掠了延安、庆阳，杨鹤将此事隐瞒下来，没有上报。杨鹤又给降贼王虎、小红狼、一丈青、掠地虎、混江龙等颁布免死文书，把他们安置在延绥、河曲一带，致使这些贼兵照旧奸淫、抢掠，当地官府却不敢过问，贼寇的祸乱就这样造成了。</p>

贼寇造成的祸乱越来越严重，王嘉胤打下黄甫、清水、木瓜之后，又攻占府谷，贼首神一元攻占了新安、宁塞、柳树涧等城堡，又将杜文焕的多数族人杀了，而神一元的弟弟神一魁又围攻庆阳，打下了合水，杨鹤得知后马上移驻宁州，神一魁接受招安，杨鹤把他送回合水交给知县蒋应昌。其他贼首见后也先后归降，杨鹤在城楼上摆了一张皇上的座席，让这些贼首跪拜，口喊万岁，然后宣读皇上的指示，命令他们发下誓言，或归伍，或归农，永不做贼。这些贼首假意答应了，杨鹤马上就赦免了他们的罪行，于是群盗都把杨鹤这个总督看作儿戏。杨鹤又因为神一魁的势力最强大，就把他的女婿请到军帐中，同吃同住，神一魁果然来降，杨鹤列举他十大罪状，神一魁就磕头请罪，杨鹤就宣读诏书赦免了他，给他封了一个官职，把他的部队四千多人安排在宁塞，派守备吴弘器防护他们。当时，将军杜文焕对此十分愤愤不平，带着他的族人离开了。</p>

神一魁的手下茹成名特别桀骜不驯，杨鹤命令一魁在耀州诱杀了茹成名，他的同伙们这下犯了疑心，胁迫着神一魁反叛了，御史谢上宾便上书弹劾杨鹤蒙骗朝廷，朝廷把他的奏疏交给巡按御史吴甡加以核对后汇报，吴甡上奏说杨鹤主张招安，误国不浅。崇祯帝恼了，把杨鹤逮捕入狱，判为充军袁州，死在充军的驻地，他的儿子杨嗣昌请加以抚恤，崇祯帝恢复了杨鹤的官位，但不加优恤。</p>

杨鹤早先因为尤世禄在宁夏的大捷，升任兵部尚书、太子少保，荫封子孙世袭锦衣千户，朝廷评论贺虎臣在宁夏大捷的功劳时，给杨鹤追加官衔为太子少傅，又因为评论甘肃的战功，任命杨鹤的一个儿子入官。</p></div>